Kontroly zahajované v červnu 2016
16/17 - Účetnictví Ministerstva zahraničních věcí
schválení kontrolního závěru: únor 2017člen NKÚ, který kontrolu řídí: Reisiegel Daniel, Ing. MPA
16/18 - Majetek a peněžní prostředky státu, se kterými je příslušný hospodařit Státní ústav pro kontrolu léčiv
schválení kontrolního závěru: březen 2017člen NKÚ, který kontrolu řídí: Pýchová Hana, RNDr.
16/19 - Peněžní prostředky státu určené na účelovou podporu výzkumu a vývoje prostřednictvím rozpočtové kapitoly Grantová agentura České republiky
schválení kontrolního závěru: březen 2017člen NKÚ, který kontrolu řídí: Neuvirt Petr, RNDr.
16/20 - Peněžní prostředky státu vynakládané Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy na rozvoj a obnovu materiálně technické základny sportu a tělovýchovy
schválení kontrolního závěru: březen 2017člen NKÚ, který kontrolu řídí: Stárek Jan, Ing.
16/21 - Správa daně z příjmů fyzických osob se zaměřením na dopady legislativních změn na příjmy státního rozpočtu
schválení kontrolního závěru: duben 2017člen NKÚ, který kontrolu řídí: Kubíček Josef Ing.