Kontroly zahajované v lednu 2016
16/01 - Peněžní prostředky Evropské unie a státního rozpočtu určené na financování opatření v rámci operačního programu Podnikání a inovace z hlediska dosažení cílů
schválení kontrolního závěru: září 2016člen NKÚ, který kontrolu řídí: Ing. Pavel Hrnčíř
16/02 - Peněžní prostředky určené na projekty informační podpory a na systémy operačního řízení složek integrovaného záchranného systému
schválení kontrolního závěru: listopad 2016člen NKÚ, který kontrolu řídí: Ing. Josef Kubíček
16/03 - Závěrečné účty kapitol státního rozpočtu Ministerstvo financí, Státní dluh, Operace státních finančních aktiv a Všeobecná pokladní správa za rok 2015, údaje pro hodnocení plnění rozpočtu za rok 2015 předkládané Ministerstvem financí za tyto kapitoly a účetnictví Ministerstva financí za rok 2015
schválení kontrolního závěru: leden 2017člen NKÚ, který kontrolu řídí: Ing. Daniel Reisiegel, MPA
16/04 - Majetek, s nímž mají právo hospodařit státní podniky v působnosti Ministerstva zdravotnictví
schválení kontrolního závěru: září 2016člen NKÚ, který kontrolu řídí: JUDr. Ing. Jiří Kalivoda